Recent phylogenetic studies based on comparisons of DNA sequences have shown that Lophiiformes (anglerfishes) and Tetraodontiformes (puffers, triggerfishes and sunfishes) were closely related, whereas no morpho-anatomical work has assessed this point. Dissections of 80 fresh specimens belonging to 49 species of 29 acanthomorph families, coupled with analyses of the literature indicate the existence of shared soft anatomy characters between Lophiiformes and Tetraodontiformes. Among acanthomorphs, anglerfishes, puffers, ocean sunfish and triggerfishes are peculiar in possessing: i) a reduced gill opening; ii) rounded and anteriorly disposed kidneys; iii) a compact thyroid included in a blood sinus; iv) an abbreviated spinal cord; v) an asymmetric liver; and vi) clusters of supramedullary neurons in the rostral part of the spinal cord. The sharing of these unusual characteristics by these two groups might be synapomorphies supporting a close relationship between Lophiiformes and Tetraodontiformes. The present study shows both the importance of comparative anatomy and the utility of confronting morpho-anatomical and molecular results. Des analyses phylogenetiques recentes fondees sur la comparaison de sequences nucleotidiques ont montre que les Lophiiformes (baudroies) et les Tetraodontiformes (poissons-coffres, balistes et poissons-lunes) etaient etroitement apparentes, tandis qu'aucune donnee morpho-anatomique ne l'attestait. La dissection de 80 specimens frais appartenant a 49 especes de 29 familles d'acanthomorphes, associee a l'analyse de la litterature montre la presence de caracteres partages touchant l'anatomie des organes mous entre les Lophiiformes et les Tetraodontiformes. Au sein des acanthomorphes, les baudroies, poissons-coffres, balistes et poissons-lunes sont particuliers en possedant : i) une ouverture branchiale reduite; ii) des reins arrondis et situes anterieurement dans la cavite abdominale; iii) une thyroide compacte incluse dans un sinus veineux; iv) une moelle epiniere courte; v) un foie asymetrique; et vi) des groupes de neurones supramedullaires dans la region rostrale de la moelle epiniere. Le partage de ces caracteres singuliers par ces groupes constitue un indice de synapomorphies probables, soutenant l'etroite parente entre Lophiiformes et Tetraodontiformes. La presente etude montre a la fois l'importance de l'anatomie comparee et l'interet d'associer et confronter les resultats des travaux morpho-anatomiques et moleculaires. Key words Lophiiformes Tetraodontiformes Phylogeny Soft anatomy